Hallo,
ich wollte mir übers "lange" Wochende einmal die EPS-Sache ansehen, und habe zuvor im Handbuch nach der EPS-Option gesucht.
Dort (
http://lilypond.org/doc/v2.18/Documentation/usage/command_002dline-usage) steht dann, daß im EPS die Schriftarten (Fonts) nicht eingebettet sind - eine Vermutung, die ich bereits beim Lesen deines Beitrags hatte.
Ich glaube, auf diese Ursachenvermutung bist Du auch schon gestoßen.
Da die normalen Noten-Fonts von Lilypond (e.g. Emmentaler) soweit ich mich entsinne auch nicht als TTF zur Verfügung stehen, wird sich Windows immer damit schwer tun.
Eine Alternative könnte also sein, im Lilypond eine andere Notenschriftart zu benutzen, welche auch als TTF zur Verfügung steht (und dann im Windows allgemein zur Verfügung gestellt wurde) - nur damit habe ich bisher keinerlei Erfahrung.
Arnold