Ein Screenshot wäre besser gewesen, kein Warten bei IMSLP und mühsames Heraussuchen der Stelle aus dem PDF (ich habe mir nicht die Mühe gemacht, sie zu suchen).
Ich arbeite inzwischen lieber mit den direkten Noten als mit Dingen wie \transpose im Notenfließtext. Warum? Einerseits ist es kaum kürzer
\transpose c des { \theme}
zu schreiben als
c8 r r4 <c' es ges as c>8-^ r r4
Andererseits sind die Ergebnisse nicht immer wie gewünscht. Ich empfehle, die Tonhöhen mit Frescobaldi zu ändern und unerwünschte Ergebnisse händisch zu korrigeren.
Du könntest z.B. \transpose c cis probieren, ob das gewünschte rauskommt.